1. Перевести Thunderbird в автономный режим
  2. Закрыть Thunderbird
  3. Переместить каталоги, где хранятся письма имеющихся учётных записей, на новое место.
  4. Запустить Thunderbird, в параметрах нужной учётной записи в пункте “Параметры сервера” указать новое место каталога для писем этой учётной записи (или отредактировать файл prefs.js)
  5. Отключить автономный режим