Короче странная ошибка натыкаться на которую я больше не хочу.
При редактировании событий cron в mcedit получил ошибку

New crontab file is missing newline before EOF, can't install

В результате на просторах сети нашел простое решение — добавить перенос строки в конце записи (чтоб была пустая строчка в конце).
Тогда все сохраняется без проблем.